很多单位的中心空调在运行中会出现各种问题，分析起来，相当一部分是由于设计部门设计不合理，甚至设计错误导致的。常见的不合理设计问题有以下几点：
中央空调冷水机组水处理注意事项
1、为了防垢，在水处理系统中设计了磁水器
磁水器的种类和名目繁多，有的称为电子除垢仪、高频水改仪等等，总之都是使水分子得到磁化，而极化的水分子具有极强的电负性，吸引钙、镁离子，从而延缓结垢时间，达到防垢的目的。具有极强的电负性的水分子也能剥蚀水垢和锈垢。因此有的厂家讲产品具有防垢、防腐、除垢、除锈的作用。的确，磁水器具有一定的上述这些正面作用。但是，假如对磁水器的安装数量及安装位置设计的不合理时，它会对水系统产生严重腐蚀，它的这种负面作用远远大于正面作用。对空调设备及水系统造成严重的危害。
2、最好不采用软化水做中心空调的补水
1987年发现钠离子交换再生废液对地下水造成永久性污染。在北京市每制一吨软化水就需要向地下排放2~5公斤食盐。由于低压锅炉水质标准GB1576的规定，几乎所有的工业锅炉都采用了软化水作为锅炉给水，北京市有9000多锅炉房，其中上规模的锅炉房就有2800多，每年要往地下排几十万吨食盐，造成了地下水永久性污染，导致人类患高血压、心脏病，癌症机率的增加等。后果十分可怕，美国己经限制使用钠离子交换器。
3、应在冷却水系统中安装立式除污器
目前全国各地的冷水机组中央空调所安装的除污器都是倒Y字型的，装在空调机组入口前的立管上，这种倒Y字型在立管上的除污器，只能捕捉设备运行初期的建筑垃圾，防止这些垃圾进入冷凝器。但是，这种倒Y字型的除污器不能在日常运行中捕捉细小水垢和锈垢，因此会引起冷凝器积垢，积泥和其它杂质。
正确的作法是在冷凝器的入水口前，安装一台立式除污器，将冷却水系统中的各种杂质截留在除污器中。
4、在空调机冷却水和冷冻水的出水侧设计快速排污阀
目前很多单位的中心空调冷却水端板或冷冻水端板处都没有安装快速排污阀，部分单位还用封堵塞住了这些排污口，其实这种做法是很错误的，易使空调机内积泥积杂质，影响热交换效率，还导致冷凝器一年一度的定期清洗。杭州空调维修服务中心专业清洗空调。
正确的作法是对冷却水系统每周从冷凝器出水口侧按“三开、三关法”排污2~3次，对冷冻水系统应每周按此法排污一次。
5、在冷却塔补水管上和冷冻水补水箱的补水管上各安装一块自来水水表。
目前相当一部分中心空调的冷却水和冷冻水补水管上没有安装自来水水表，使得用户不知道系统中共有多少水，也不知道每日补多少吨水，为运行治理带来了很多麻烦。因为中心空调水处理一般采用药剂处理，必须按补水量和系统水量投药，因此这二块水表在设计上是不能少的。

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